半个月后，平辽大军凯旋。
朱由检再次举办阅兵式。
并对有功之臣大加封赏，其中谷雨被封为太师、特进荣禄大夫、右柱国，进位辽国公，执掌左军都督府。
左军都督府是五军都督府的一部，统领京城为左卫、镇南卫、水军左卫、骁骑右卫、龙虎卫、英武卫沈阳左卫、沈阳右卫；地方为浙江都司、辽东都司和山东都司。并兼管南京左军都督府。
五军都督府的前身是大都督府，是明朝军队的最高权力机关。洪武十三年，朱元璋觉得大都督府的权力太大了，便把大都督府改名为五军都督府，其目的是加强皇权对军权的控制。
五军都督府主要负责整个明朝的领兵作战、掌管军籍和全军将领的推选，同时也会完成皇帝的特派任务。而且由于明朝时期特有的军户屯田制，所以五军都督府还掌管天下屯政。
但到了明朝中期，六部之一兵部的崛起，五军都督府慢慢的就失去了调动军队的权力，只掌握了统领军队之权。五军都督府和兵部相互节制且互不统属。
在明朝后期，随着文官的权力越来越大，整个明朝的军事体制由五军都督府和兵部的互相节制变成了兵部的一家独大。军队的调派权和统领权由兵部掌管，而军户屯田的权力慢慢的交由户部来处理，就连最受皇帝倚重的特派任务，也由下面的锦衣卫抢走。
崇祯皇帝朱由检封谷雨为左军都督府左都督，其实就是想把他高高挂起，同时又想利用他的想法进行变法，进而中兴大明，成就朱由检的不世之功。。
本质上就是把谷雨变成他的私人秘书。
甚至为了限制谷雨的军权，朱由检又开始重点打造同属于御马监的勇士营。
就是想着仿效四卫营，重新打造一支虎威军来。
在朱由检想来，同为锦衣亲军世家子弟，谷雨没参加过萨尔浒之战，还曾是沈炼属下，而周遇吉、虎大威、猛如虎等人也没有黄得功名声响亮，又有曹化淳关注，傲人给人，要钱给钱，只需一两年，定然能再造一只强军。
那个时候谷雨脑子里的那些变法，也估计被掏空了，到时候若是他听话，把他赶到津门就行了。
可若是谷雨持功而娇，那就别怪他祭出杀手锏了。
可是朱由检忽略了一点。
五军都督府虽然名存实亡，但实际上它的职责和权力并没有变，只是缺乏能人有效运用而已。
更何况，谷雨所统领的左军都督府，包括辽宁都司。
而辽宁地方的军队，现在几乎都是谷雨一手打造出来的。
里面的军官多是谷雨提拔于微末，兵教授了她们文化知识。
这些人身上有着谷雨深深地烙印，自然对他唯命是从。
崇祯三年开始，辽宁各路军队遵照谷雨的命令，大力改造军队性质，配合当地官府丈量土地，整治民户，更有从津门出发的商团在白山黑水之间整顿商务。
户部和兵部想伸手，却发现那里的人根本不买账。
他么只听左军都督府的。
户部尚书毕自严有谷雨教授的新盐税法，国库收入大增，因此从内心深处支持谷雨的整顿。
而兵部更是在左军都督府面前抬不起头来。
于是经过一年多的争夺，五军都督府夺回了大部分权力。
紧接着，谷雨的左军都督府把手伸向了浙江都司、山东都司和金陵左军都督府。
为了找到足够的人才，谷雨在五军都督府开办讲武堂，教授目标是屡试不中的秀才、识字的低级军官。
通过源源不断的培养人才，又源源不断的派遣出去，在一两年内，左军都督府便掌握了法理内所掌控的所有权力。
而在这个时候，陕西一带却乱了起来。
从万历年开始，陕西就是连年大旱，尽管皇帝在陕西几个地方推行了摊丁入亩，但官府和士绅连在一起，依旧狠狠地其他剥削农民，终于有大批的农民，在高迎祥、张献忠、李自成等一大批民间积极分子的带领下揭竿而起，发动了轰轰烈烈的农民大起义。
崇祯朱由检被农民起义吸引了注意力，不断地派遣官兵去围剿，结果经过一两年的围剿战事，朱由检这才发现，凡是能立功崛起的军官，多有在左军都督府讲武堂进修过的经历，这些人已经烙上了谷雨的印记。
虽说他们肯定也会以效忠天子，效忠大明为主要信仰，可是谁敢赌？
更让崇祯皇帝觉得难受的是，由于内阁阁老一个个的尸位素餐，不好好做事，被他一个又一个的换来换去，仅短短的崇祯三年，他就换了四个内阁首辅，直到周廷儒上台。
但周廷儒是大明朝的祁同伟，不但贪污腐败，陷害忠良，还安插亲信，甚至他还把自己的哥哥周素儒，予以冒牌的锦衣卫身份，并加封为千户之职，最为可笑的是他把自己的亲戚周文郁任命为副总兵，可谓是一人得道，鸡犬升天，搞的京城百官天怒人怨。。
崇祯发现自己的权力越来越运转不灵，一时之间并没有注意到是周廷儒在挖他的墙角，反而认为是谷雨这个武官之首在抢夺他的权力。
于是朱由检便秘密制定了一个计划。
崇祯五年五月，因农民起义蜂拥再起，搅的三秦大地如同浆糊，崇祯趁机和谷雨商议，派遣满桂、周遇吉、卢剑星等将军前去剿灭陕西叛乱，同时秘密调动秦良玉的五千白杆兵入京。
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